Command and Conquer: Alarmstufe Rot 3 bietet euch eine große Vielzahl von verschiedenen Missionen und Einsatzorten. Ihr werdet hierbei durch verschiedene Länder kämpfen, wie zum Beispiel Russland, Japan oder die USA und werdet dabei sogar manche echte Stadt wiederfinden. Namenentlich sind das zum Beispiel Moskau oder New York. Zudem sind viele der Städte optisch sehr gut angepasst und bieten daher eine hohe Abwechslung, welche sich in den verschiedenen Missionen bzw. Einsatzorten widerspiegelt.
Dies sind die jeweiligen Einsatzorte bzw. Missionen:
Sowjets
Sowjets- Leningrad – Der Würger und die Dornen
- Krasna-45 – Verrat
- Wladiwostok – Eroberung des Eishafens
- Genf – Marsch der roten Armee
- Mykonos – Die Kunst des Krieges
- Von Esling Airbase – Ende aller Verräter
- Mt. Juji – Bändigung eines Gottes
- Osterinsel – Die steingewordenen Zeugen
- New York – Big Apple in Flammen
Alliierte
Alliierte- Brighton Beach – Die rote Bedrohung
- Cannes – Der Hai und die Beute
- Heidelberg – Die große Befreiung
- Gibraltar – Feind unseres Feindes
- Nordsee – Die unfassbare Festung
- Mt. Rushmore – Mahnmal des Wahnsinns
- Tokio-Hafen – Die letzte Abendröte
- Havana – Die große Bärenfalle
- Leningrad – Mond über Sankt Petersburg
Reich der aufgehenden Sonne
Reich der aufgehenden Sonne- Vorkuta – Der Tod von Väterchen Frost
- Stalingrad – Ende aller Hoffnung
- Odessa – Der mächtige Schwertheilige
- Pearl Harbor – Grab einer törichten Flotte
- Pazifik – Angriff auf die Black Tortoise
- Santa Monica – Zorn der Black Tortoise
- Yokohama – Belagerte Barbaren
- Moskau – Nieder mit dem Kreml
- Amsterdam – Die letzte Tulpenblüte
