Mit dem Alarmstufe Rot wurde wahrscheinlich das verrückteste Universum erschaffen, dass es je in einem RTS-Spiel gab. Zeit spielt nämlich keine Rolle mehr! Während im ersten Krieg der Gegner besiegt worden zu sein scheint, taucht er auf einmal in der Vergangenheit auf uns schriebt die gesamte Geschichte um. Wie der Name schon sagt, geht es in den Grundzügen um den Konflikt zwischen der Sowjetunion und den Alliierten. Hier ist nun die Geschichte der Alliierten!
Gründung und Ziele:
Die Alliierten sind ein Kampfbündnis, welches aus europäischen und amerikanischen Ländern besteht. Innerhalb der Zeit treten auch einige außerhalb liegende Länder hinzu, wie z.B. Korea im 2. Krieg. (Man kann davon ausgehen, dass damit auf den Koreakrieg angespielt wurde).
Das genaue Datum der Gründung des Bündnisses der Alliierten ist unklar. Das Bündnis entstand durch eine Zeitreise, die Albert Einstein unternahm, um Adolf Hitler im Raum-Zeit-Kontinuum verschwinden zu lassen. Dadurch kam es erst zu dem Konflikt, da die Russen nun unkontrolliert aufrüsten konnten.
Das Bündnis gilt zur Verteidigung aller freien Demokratischen Länder gegen die bösen Russen, die ganz Westeuropa einnehmen wollen. Als der Krieg anfing, war Erz der wichtige Rohstoff, der gesammelt werden musste um die Kriegsmaschinerie seiner Fraktion gehörig anzuheizen.
Die Alliierten und die Sowjets unterscheiden sich stark in der Waffentechnologie. Während die Russen auf altbewährte Waffen und überstarke Panzer setzen, kommen die Alliierten mit neuen Technologien und Seeeinheiten daher. Im späteren Kriegsverlauf blüht sie außerdem in der Luftwaffe auf. Tarngeneratoren, Chronsophären und Satelliten unterstützte Aufklärung sind so die Geheimwaffen der Alliierten.
Alarmstufe Rot 1 und die Alliierten:
Durch die Zeitreise Einsteins und das Verschwinden Adolf Hitlers, war der zweite Weltkrieg zwar verschoben, aber nicht aufgehoben. Da das deutsche Reich nicht mehr ohne ihn bestehen konnte breitete sich die Sowjetunion immer weiter in Europa aus, bis es zur endgültigen Invasion kam. Dies alles geschah im Jahre 1946 als er zurückreiste und Adolf Hitler seine Hand reichte, als er gerade aus seiner Gefängnishaft (wegen einer gescheiterten Machtübernahme) entlassen wurde. Auf einmal war er puff in blaues Pulver verwandelt worden.
Als Eistein wieder in der Zeit zurückreiste erlebte er ein blaues Wunder, denn die Russen hatten bereits ganz Osteuropa unter ihrer Kontrolle und machten sich zum Angriff auf die Westlichen bereit. Einstein wird von den Russen festgenommen. Das Ziel des Commanders ist es nun mit der Spezialagentin Tanya (die Kommandoeinheit in RA1) das Supergenie zu befreien und so der Alliierten Streitkraft den Rückstand in Sachen Technologie wett zu machen, denn die Russen besaßen bereits die neuentwickelte gefährliche Stromwaffe Nicola Tesla´s. Mit jeder Mission, die der Commander bewältigen muss, wird die Lage schwieriger und gefährlicher, denn er ist der einzige, der sich traut einen Gegenangriff zu starten.
Inzwischen hat die Sowjetunion den gesamten Mittelmeerraum bis Griechenland eingenommen und unterdrückt das Volk. Allein der Commander kämpft sich durch die feindlichen Linien und schlägt die bösen Russen Schlag um Schlag zurück. Doch dann wird Stalin, der Anführer der Russen unfair und will den Commander sowie den Rest der Alliierten mit Atomwaffen angreifen und seine neue Technologie, den Eisernen Vorhang, anwenden. Und wieder liegt es allein in der Hand des Commanders die Gefahren auszuschalten und so Millionen von Menschen das Leben zu retten. Zum Schluss wird Moskau dank der neuen Technologie Einsteins eingenommen, welche es möglich machte starke Truppenverbände von einem Punkt zu einem anderen zu teleportieren, und so die feindlichen Linien zu umgehen. In der Endszene sieht man den gefürchteten russischen Diktator verschüttet unter einem Steinhaufen liegen. Der alliierte griechische General Stavros schmeißt den noch jämmerlich rufenden Diktator einen Stein auf de Kopf, um sich bei ihm zu rächen. Der Krieg scheint gewonnen zu sein!