Yuris Rache und die Sowjetunion:
Nach der sowjetischen Niederlage tauchte Yuri bald auf und teilte dem amerikanischen Präsidenten Dugan mit, dass er mit seinen Psychic Dominators die Welt erobern würde. Die Alliierten benutzten Einsteins Zeitmaschine, um in der Zeit zurück zu reisen, um Yuri aufzuhalten. Die Sowjets und die Alliierten unterzeichneten in der veränderten Zeitachse einen Vertrag, welcher dazu dienen sollte, Yuri zu besiegen. Allliierte und Sowjets Seite an Seite.
Nachdem die letzte Psychowaffe zerstört wurde, wird Yuri festgenommen und in eine spezielle Zelle namens Psychische Isolationszelle gesteckt. Von dort aus kann er nun niemanden mehr manipulieren.
Mit Yuris Niederlage schien Frieden auf der Welt zu herrschen. Das Misstrauen zwischen den Alliierten und der Sowjetunion blieb jedoch bestehen. Dies wurde zu einer Nachkriegskrise zwischen den beiden Supermächten, als die Alliierten, diesmal die Aggressoren, die sowjetische Armee angriffen, um nie wieder angegriffen zu werden. Trotz des erbitterten Widerstandes der Kommunisten drängten die Alliierten weiter in das sowjetische Territorium vor, bis sie sich auf der rechten Seite Moskaus befanden. Während der Krise entwickelte der sowjetische Wissenschaftler Dr. Gregor Zelinsky eine Zeitmaschine, die auf den Entwürfen von Einsteins Prototyp unter der Aufsicht von Oberst Chervenko basierte. Als die Alliierten Moskau überfielen und Premier Romanov aus der Stadt floh, überzeugte Chervenko General Krukov und Selinsky, die Zeitmaschine zu benutzen und Eeinsein bei einer Konferenz im Jahr 1927 zu löschen.
Alarmstufe Rot 3 und die Sowjetunion:
Nach dem Löschen von Einstein aus der Geschichte brachen die Sowjets den Eisernen Vorhang und stürmten Westeuropa. Ohne Einstein waren die Alliierten auf der Flucht, aber die Sowjets brachten unwissentlich eine neue, pazifischstämmige, technologisch fortgeschrittene Supermacht hervor: Japan, in Form des Reich der aufgehenden Sonne. Die Japaner drangen von Osten in die UdSSR ein, und die Sowjets waren gezwungen, sie aus ihrem Mutterland zu drängen, indem sie Leningrad, die Krasna-45-Startanlage und Wladiwostok und andere Städte, die von japanischen Truppen angegriffen wurden, zurückzuerobern.
In Westeuropa drängten die Alliierten die Sowjets hinter dem Eisernen Vorhang zurück, Osteuropa blieb unter sowjetischem Einfluss.
Die Sowjets haben Kaiser Yoshiro am Berg Fuji ermordet. Die Sowjets und die Alliierten haben ein Bündnis gegen das Imperium geschlossen. Beide Fraktionen drängten das Empire zurück nach Tokyo zurück. Das Empire wurde zu einer Ruines seines einstigen Glanzes.
Nachdem Präsident Ackerman einen gescheiterten Versuch unternommen hatte, Moskau zu zerstören, und sowjetische Vergeltungspläne entdeckt wurden, um mit Hilfe von H-Bomben aus Kuba alliierte Städte zu zerstören, wurde das Bündnis umgehend aufgekündigt. Das Endergebnis war die Belagerung von Leningrad.
Am Ende des Krieges war die einst mächtige Sowjetunion auf einen besetzten Staat reduziert worden, der in 15 verschiedene Republiken aufgeteilt war. Premier Chervenko und General Krukow wurden festgenommen und wegen Verbrechen gegen die gesamte Menschheit für immer zum Cryo-Gefängnis verurteilt.
Der Aufstand und die Sowjetunion:
Aber trotz der starken Präsenz der alliierten Besatzungstruppen ergaben sich nicht alle sowjetischen Truppen. Als der Aufstand ernsthaft begann, bildeten einige eine Widerstandsbewegung unter Dascha. Die Bemühungen und die Existenz des Sowjetischen Untergrunds wurden offiziell von der Europäischen Union ignoriert, die behauptete, die besetzten Gebiete würden sich enthusiastisch an sozioökonomische Veränderungen anpassen. Dies wollte man zu mindestens der Bevölkerung weiß machen.
Der Untergrund erwies sich als fähiger bzw. widerstandsfähiger als die Alliierten erwarteten. Die Sowjets brachen in eine Reihe von Futuretech-Installationen ein und entdeckten die Entwicklung des Sigma-Harmonizers, den der EU-Präsident Rupert Thornley nutzen will, um die Sowjetunion von der Erde zu tilgen und aus den Geschichtsbüchern zu streichen. Die Widerstandstruppen entdeckten schließlich den Standort des Harmonizers auf der Sigma-Insel und zerstörten ihn, bevor er vollständig in Betrieb gehen konnte. Da der Untergrund das dunkle Geheimnis von Futuretech offenbarte, hielten die Alliierten die Sowjetunion für vertrauenswürdig und zogen als Beweis des guten Willens alle Truppen aus Russland ab.
*Anmerkung: Die Geschichte der Sowjetunion wird hierbei aus Sicht der Alliierten (welche meistens die Grundlage der Geschichte ist) wiedergegeben. In der alternativen Geschichte (wenn man in der Kampagne die Sowjets auswählt) sind die Sowjets in der Regel die Sieger und dominieren die Geschichte. Jedoch spiegelt die Alliierten-Geschichte die eigentliche Fassung wieder.